Lancet Oncol:肾透明细胞癌与肥胖悖论相关的基因表达组特征分析

2021-11-15 17:57:13 来源:
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一.深入研究背景

颇高血压与肾表面细胞膜肺癌 (ccRCC)的效用提颇高有关,但颇高血压又嫌隙地与该的HRS改善有关,其潜在的系统尚不确切。现作者对颇高血压病病症和较长时除此以则有体形病病症在原发和肉瘤周脂质组成员织之前的肾脏聚合和免疫转录组成员区别顺利进行深入研究归纳。

本文介绍了基因组此表达引起的微环境的区别最大限度表述颇高血压病病症的生存优势(颇高血压断言)。

二.归纳流程三.社论问答1.COMPARZ数据库流、TCGA-KIRC数据库流、MSK免疫疗程数据库流数据库收集、矫正

在COMPARZ数据库流的453名病病症之前,有375名(83%)病病症具备可用的微阵列数据库,疗程前BMI测量以及无进展和基本上生存数据库顺利进行归纳(此表1)。除119名(26%)较重病病症则有,来自COMPARZ试制的之后数据库流最主要256名(68%)病病症(n=256)。

此表1.COMPARZ流行病学试制数据库流的现有人口统计分析和流行病学基本特征

TCGA-KIRC数据库流之前的332例病病症之前,审核了经肾切除术疗程的152例(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病病症的流行病学和现有人口统计分析数据库(此表2)。在考虑59名(39%)较重病病症后,最后获得的数据库流最主要93名病病症(n=93)。

此表2.晚期表面细胞膜肾细胞膜肺癌TCGA-KIRC数据库流的现有人口学和流行病学基本特征

从62例MSK附近脂质组成员织数据库流之前顺利进行肾脏切除术的非白血病表面细胞膜RCC病病症之前获得了原发性和附近脂质样品。在这个数据库流之前,从59名病病症的PNN(肾周附近)附近脂质,25名病病症的PNA(远离肾周)附近脂质以及55名病病症的组成员织之前取样。在考虑较重病病症之后,之后数据库流最主要41名(69%)PNN样品病病症, PNA样品为17(68%),样品为37(67%)。从最初的203名组织者的MSK免疫疗程深入研究人这群人之前考虑74名(36%)较重病病症后,总生存归纳的之后数据库流最主要129名(64%)组织者(此表3)(n=129)。

此表3. 换用MSK免疫疗程的流行病学试制数据库流的现有人口统计分析和流行病学基本特征

2.颇高血压的肾表面细胞膜肺癌病病症一般来说较长时除此以则有体形的肾表面细胞膜肺癌病病症总生存期较长

根据KM生存归纳,在三组成员之前都见到颇高血压病病症的总生存期较长。在TCGA-KIRC数据库流之前,经仍须校对后,颇高血压病病症的基本上存活期工于较长时除此以则有体改组成员;在COMPARZ数据库流之前,经IMDC效用打分校对后,胖病病症的基本上存活期也工于较长时除此以则有体改组成员。在MSK免疫疗法数据库流之前,经IMDC效用打分校对后,BMI与死亡率的无很大区别(如三幅1)。

三幅1.TCGA-KIRC数据库流 (A)、COMPARZ 数据库流(B)和MSK免疫疗程数据库流(C)的总生存期

3.COMPARZ数据库流之前颇高血压病病症具备更容易的PFS

对CPMPARZ数据库流KM归纳后,KM椭圆辨识,COMPARZ数据库流之前颇高血压病病症较为长时除此以则有体形病病症具备更容易的PFS。

三幅S1.COMPARZ数据库流之前颇高血压病病症较为长时除此以则有体形病病症具备更容易的PFS

4.用于中卫药剂疗程,颇高血压病病症仍具备更容易的OS

KM椭圆辨识了在用于中卫赖氨酸趋化因子类固醇(pazopanib或Sunitinib)的两个疗程组成员之前,颇高血压病病症的OS一直较较长时除此以则有体形病病症好。

三幅S2.COMPARZ数据库流用于中卫药剂疗程组成员的总生存期归纳

5.COMPARZ数据库流之前,颇高血压与较长时除此以则有体形的病病症转录组成员基因组基本特征假定很大区别

做完上述归纳,作者在三个数据库流之前确认颇高血压断言假定之后,接下来在COMPARZ数据库流之前对颇高血压和较长时除此以则有体形病病症审核了转录组成员学区别。后于做了Hallmark基因组集的GSEA归纳,较为颇高血压病病症与较长时除此以则有体形病病症之除此以则有的区别:颇高血压病病症之前辨识脱水、TGF-β、黏膜-除此以则有充质变革和肾脏聚合讯号通道很大上调,提示内脏钙化都能的激活(三幅A)。三幅B是对三幅A挑选出的几个基因组此表达通道的Enrichment plots。

三幅S4.COMPARZ数据库流之前颇高血压病病症与较长时除此以则有体形病病症的ccRCC转录组成员基因组基本特征假定很大区别

6.COMPARZ数据库流与TCGA-KIRC数据库流 之前颇高血压较为长时除此以则有体形病病症的肾脏聚合打分颇高

在GESA衍生的基本特征基因组集肾脏聚合打分较为之前,颇高血压病病症颇高于较长时除此以则有体形病病症(如三幅2)。

三幅2.COMPARZ数据库流(A)与TCGA-KIRC数据库流 (B)之前颇高血压原发病病症与较长时除此以则有体形病病症的肾脏聚合的z score

7.较长时除此以则有体形与颇高血压病病症的肝细胞膜这群人无很大区别

对较长时除此以则有体形(7例)与颇高血压(16例)病病症的原发的主要肝细胞膜数量均换用流式细胞膜术顺利进行审核。三幅A辨识了颇高血压病病症与较长时除此以则有病病症之除此以则有的肝细胞膜这群人的基本上区别。三幅B确切辨识了颇高血压和较长时除此以则有体形病病症T细胞膜这群人的诱发水准。见到较长时除此以则有体形与颇高血压病病症的肝细胞膜这群人无轻微区别,肝细胞膜诱发的程度与BMI无关。

三幅S9.用流式细胞膜术归纳较长时除此以则有体形与颇高血压病病症的肝细胞膜这群人无轻微区别

8.与较长时除此以则有体形病病症远比,颇高血压病病症肉瘤周脂质组成员织炎病症提颇高,特别是附近的肉瘤周脂质

在MSK的非白血病ccRCC病病症的革命性数据库流之前,作者合并了20个最很大的丰富的IPA规范通道,这些通道来自于颇高血压和较长时除此以则有体形病病症的PNN和PNA样品的较为(三幅A)。颇高血压和较长时除此以则有体形病病症的PNN和PNA样品之除此以则有的免疫诱发(ssGSEA打分)较为(三幅B)。

三幅S5.与较长时除此以则有体形的病病症远比,颇高血压病病症的肾周脂质辨识出炎病症和脱水提颇高

综上,在COMPARZ试制数据库流之前,经过IMDC效用打分调整后,见到一般来说较长时除此以则有体形病病症,赖氨酸趋化因子类固醇疗程提颇高了颇高血压病病症的存活率,特别是给予sunitinib疗程的病病症。IMDC效用打分模型包含的成份除此以则有接突显宿主各种因素对肺癌病症有系统炎病症作用(例如病变,之前性粒细胞膜增多,和淋巴细胞增多病症),这些各种因素可能也是免疫疗程结果和BMI之除此以则有关联的系统的原因。见到颇高血压病病症的肾脏聚合分数颇高于较长时除此以则有体形病病症,与之前其他的深入研究结果此表明的,策划肾脏聚合,β-氧化都能等等基因组的富集的现象一致。因此,肾脏聚合的区别可以部分表述颇高血压病病症给予赖氨酸趋化因子类固醇疗程后的较好HRS。

此深入研究为颇高血压断言缺少了生物学全力支持。在患有ccRCC的病病症检视到颇高血压病病症一般来说较长时除此以则有体形的病病症微环境的区别:特别是颇高血压病病症的的肾脏聚合提颇高,但基本上炎病症无轻微区别。值得注意的是颇高血压病病症的附近脂质辨识提颇高的炎病症和脱水状况。表面细胞膜肺癌与肉瘤周脂质组成员织微环境的精细相互作用可能具备流行病学意义,值得进一步深入研究。

原始引自:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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